Francisco me suena muy raro todo eso y yo te diría, puedo estar equivocado, que no tiene nada que ver un simulador con el otro a la hora de configurar las opciones de los mandos. Te diré que yo tengo los dos simuladores en el mismo ordenador y nunca me ha sucedido nada de eso. Sí que configuro los mandos en Prepar mediante el FSUIPC que a su vez puedo configurarlo para todos los aviones o un "preset" para cada uno de ellos. El X-Plane me resulta mucho más fácil (ahora) porque me muestra el dibujo de mis joy, palanca y pedales, que en estos últimos he podido configurar los frenos independientes de cada rueda lo que no he sabido hacer todavía con Prepar.
A ver si algún otro compañero nos puede dar alguna luz, siento no poder ayudarte. Un saludo

Antonio, muchas gracias por contestar.
La verdad es que cambió practicamente todo en FSX, no se que puede ser. Seguiré esperando un poco mas a ver si alguien le ha sucedido lo que a mí, y me puede dar la solución.
De nuevo muchas gracias y un saludo-

Hola Francisco. No me gusta contestar si no puedo ayudar por eso no he puesto nada, pero al igual que al compañero yo tengo el P3D-V4 y el xplane 11. y no tengo ese problema. Yo no utilizo FSuipc para configurar los mandos lo hago directamente con el rpograma. Lo que si tengo es una copia de la configuracion de los mandos y si tengo algun problema la importo y ya esta, pero creo que el FSX no tiene esa opcion.
Tambien te puedo decir que tengo los dos simuladores en el mismo disco un SSD  de 500Gb.

repetido

Gracias Faustino.
Ya estoy viendo que si a vosotros os va, puede ser que sea un problema de mi ordenador. Ya iré probando y a ver si doy con la solución.
Muchas gracias y saludos.