Este aeropuerto tiene una restricción de visibilidad y sólo funciona durante el día debido a la necesidad de una aproximación visual a tierra. Los aviones operan principalmente en una dirección de vuelo, para salir de este aeropuerto se utiliza la pista 10 y se aterriza por la pista 28. Durante las situaciones de tiempo en el que no se puede hacer una aproximación visual el aeropuerto está cerrado hasta que el clima mejore. Ningún piloto se atreve a aterrizar con cielo nublado, en un aeropuerto completamente rodeado de montañas y sin guía de precisión o ayudas a la navegación. Por lo tanto, todos los aterrizajes realizados son únicamente visuales, aplicando reglas estrictas VFR. El avión más grande que se le permite operar aquí es un B757-200, sin embargo, cualquier aparato más grande que un B737-200 necesita una autorización gubernamental.

ESCENARIO MACHU PICCHU FS9: http://www.flightsim.com/kdl.php?fid=70369

Partiendo del aeropuerto de Cuzco sobrevolar las ruinas del Machu Picchu, coordenadas 13°9′48″S 72°32′46″O, y aterrizar en Lima.
Vuelo VFR

EL SECRETO DE LOS INCAS (1954) con Charlton Heston, Nicole Maurey y Robert Young.